Dentre as atividades que compõem o projeto “História Natural de Peixes de Água Doce”, destaca-se o estudo subaquático dos peixes da bacia do rio São Francisco. O principal objetivo desta pesquisa é ampliar o conhecimento acerca das espécies de peixes desta bacia, com relação à distribuição, ecologia, biologia comportamental e grau de ameaça, fornecendo, assim, informações importantes para a conservação dos peixes a longo prazo.

As observações subaquáticas são conduzidas através das técnicas de mergulho livre e autônomo. Em corpos hídricos de menor porte são realizados mergulhos livres, com o auxílio de máscara, snorkel, roupa de neoprene e nadadeiras. O  mergulho autônomo, que utiliza também colete, reguladores e cilindro de ar comprimido, é realizado para observações mais prolongadas e em ambientes de difícil acesso.