Para estudar a história natural das espécies de peixes da Bacia do Rio São Francisco, os pesquisadores do projeto irão investigar, através de mergulhos técnicos, quatro regiões hidrográficas desta bacia:
1 – Alto Rio São Francisco
Áreas de mergulho: Rio São Francisco no Parque Nacional da Serra da Canastra e entorno; Rio São Francisco em Vargem Bonita.
2 – Bacia do Rio Cipó
Áreas de mergulho: Rio Cipó e afluentes no Parque Nacional da Serra do Cipó e entorno; Rio Cipó em Santana do Riacho e em Santana do Pirapama.
3 – Calha do Rio São Francisco
Áreas de mergulho: Rio São Francisco a jusante de Três Marias; Rio São Francisco e afluentes na região de Pirapora/Buritizeiro.
4 – Várzeas e veredas do médio São Francisco / Rio Pandeiros
Áreas de mergulho: lagoas marginais do Rio São Francisco; pantanal do Rio Pandeiros.
Rio São Francisco na represa de Três Marias
Rio Cipó em Santana do Riacho
